一、职能与支撑部门
      综合处（人事处）
      党委办公室
      科技处
      财务处
      基建条件处
      成果转化中心
      创新传播中心（学报编辑部）
      创新促进中心（基地管理办公室）
 

二、科研部门
      油菜遗传育种研究室
      大豆研究室
      花生研究室
      芝麻与特色油料研究室
      种质资源学研究室
      基因组学与分子生物学研究室
      基因工程与转基因安全评价研究室
      环境生物学研究室
      产品加工与营养学研究室
      质量标准与食品安全研究室